La historia de Teguise se remonta a la época aborigen, situándose en el entorno de la actual Villa la "Gran Aldea de Acatife", uno de los principales núcleos de población maja. Otro de los asentamientos más importantes de Lanzarote fue Zonzamas, principal yacimiento arqueológico de la isla, que se encuentra en el ámbito territorial de este municipio. Tras la conquista normanda, el sobrino de Jean de Bethencourt, Maciot, heredero del señorío de Canarias, funda Teguise, tercera urbe colonial de Canarias después de San Marcial del Rubicón, al sur de Lanzarote, y Betancuria, en Fuerteventura. Teguise se convierte en la capital de la Isla debido a su emplazamiento geográfico, en el centro de la misma, a resguardo de los ataques piráticos, que aun así sacudieron a la población en varias ocasiones. La montaña de Guanapay servía como atalaya de vigilancia al divisarse desde ella la práctica totalidad de las costas de la isla. Allí se contruyó una fortaleza defensiva, el Castillo de Santa Barbara, en el que hoy se encuentra el Museo del Emigrante Canario. Teguise creció especialmente apartir de mediados del siglo XVI constituyéndose un importante entramado urbano que se conserva hasta la actualidad. En la Villa se concentraban las principales instituciones de la isla, como el Cabildo o la escribanía, así como los principales centros eclesiásticos.

Sin embargo, en el siglo XIX el puerto de Arrecife va tomando un mayor peso económico y social, trasladándose la capital de la isla a dicha ciudad en 1847. En esa mismas fechas se desarrollará en el municipio de Teguise una importante actividad en torno al cultivo de la cochinilla, insecto parásito de la tunera o chumbera del cual se extrae el tinte color carmín. La cochinilla se seguirá produciendo hasta la actualidad, fundamentalmente en las localidades de Mala y Guatiza.

En las últimas décadas el turismo se ha convertido en una de las principales fuentes económicas del municipio, principalmente en la localidad de Costa Teguise, uno de los tres principales centros turísticos de Lanzarote.

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